背景与目的:肝细胞癌（HCC）是常见的原发性肝癌,其预后较差。自噬的失调可以促进HCC的发生与进展,本研究旨在分析自噬相关长链非编码RNA（lnc RNA）在HCC患者中的潜在预后作用,并构建自噬相关lnc RNA风险预测模型。方法:利用生物信息学方法分析TCGA数据库中374例HCC及50例正常对照样本的转录组数据及临床资料,从HADb网站获取自噬基因列表。采用Person相关性分析筛选与自噬基因相关的lnc RNA,采用R软件caret程序包将筛选后的342例HCC样本按70%与30%的比例随机分为训练集及验证集,在训练集中采用Kaplan-Meier法及单因素Cox回归分析筛选出具有预后意义的lnc RNA,随后采用多因素Cox回归分析筛选具有独立预后意义的自噬相关lnc RNA,建立构建预后模型。使用多因素Cox回归系数计算风险评分,将患者分为低风险组和高风险组,分析算风险评分与HCC患者临床特征及总体生存的关系,并使用验证集加以验证。结果:347个lnc RNA鉴定为自噬相关lnc RNA（|R~2|>0.3,P<0.001）,其中26个lnc RNA对HCC患者具有预后价值（均P<0.05）。多因素Cox回归分析得到基于12个自噬相关lnc RNA（CYTOR、DANCR、LINC01138、LUCAT1、MAPKAPK5-AS1、NRAV、NRSN2-AS1、LINC01871、LINC00864、LINC02362、TMEM220-AS1和PSMB8-AS1）的预测患者预后的风险模型。高风险组HCC患者总生存期明显低于低风险组HCC患者（P<0.05）。12-自噬相关lnc RNA预后模型评分与肿瘤分级、肿瘤分期和T分期有关（均P<0.05）,与患者的年龄、性别无明显关系（均P>0.05）。在训练集中该预后模型的1、3、5年生存的时间依赖性ROC曲线的曲线下面积（AUC）分别为0.801,0.819和0.787,在验证集中其1、3、5年生存的时间依赖性ROC曲线的AUC分别为0.694、0.733和0.746。结论:所筛选的自噬相关lnc RNA在HCC的肿瘤生物学中可能起关键作用,12-自噬相关lnc RNA的模型对HCC具有预后判断价值。