目的观察经皮肾镜下气压弹道碎石术与超声碎石术治疗感染性肾结石的疗效。方法回顾性分析应用经皮肾镜气压弹道碎石术与EMS三代超声碎石术两种方法治疗的128例感染性肾结石患者的临床资料,比较两组治疗效果及并发症。结果气压弹道组结石完全取净52例（85.25%）,EMS三代超声组结石完全取净64例（95.52%）,两组比较差异有统计学意义（P<0.05）。气压弹道组碎石时间（1.37±0.47）h,EMS三代超声组手术时间（1.33±0.41）h,两组比较差异无统计学意义（P>0.05）。气压弹道组住院时间（9.30±1.44）d,EMS三代超声组住院时间（6.43±1.10）d,两组比较差异有统计学意义（t=12.68,P<0.05）。气压弹道组术后出现并发症15例（24.59%）,EMS三代超声组术后出现并发症5例（7.46%）,两组比较差异有统计学意义（P<0.05）。结论对于感染性肾结石的微创治疗,经皮肾镜下EMS三代超声碎石术治疗效果优于气压弹道碎石术,且患者恢复较快、并发症较少。